یکی از مهم‌ترین ریسک‌های عدم وجود قرارداد خرید سیستم اتوماسیون اداری، عدم تطابق دقیق سیستم با نیازهای خاص کسب‌وکار است. بدون یک قرارداد جامع که مشخصات فنی سیستم، کارکردهای مورد انتظار و نحوه یکپارچگی آن با سیستم‌های موجود را به تفصیل بیان کند، امکان بروز مشکلات جدی در این زمینه وجود دارد. این عدم تطابق می‌تواند منجر به اتلاف وقت، هزینه و منابع شده و بهره‌وری سازمان را کاهش دهد. علاوه بر این، ممکن است نیاز به تغییرات گسترده و هزینه‌بر در سیستم خریداری شده باشد که این امر می‌تواند به طور قابل توجهی هزینه‌های کل پروژه را افزایش دهد.

همچنین نبود یک جدول زمانی دقیق و الزام‌آور در قرارداد، یکی از دلایل اصلی بروز تاخیر در تحویل سیستم اتوماسیون اداری است. این تاخیر می‌تواند به طور مستقیم بر فعالیت‌های روزمره سازمان تأثیر گذاشته و منجر به اختلال در فرآیندهای کسب‌وکار شود. همچنین، تاخیر در تحویل سیستم می‌تواند هزینه‌های اضافی ناشی از استفاده از سیستم‌های قدیمی یا روش‌های دستی را به دنبال داشته باشد. علاوه بر این، ممکن است به دلیل تاخیر در اجرای پروژه، فرصت‌های تجاری ارزشمندی از دست برود.

در صورت بروز مشکلات فنی در سیستم خریداری شده، عدم وجود یک قرارداد جامع که شرایط گارانتی، پشتیبانی و تعمیرات را به طور دقیق مشخص کند، می‌تواند به یک چالش بزرگ تبدیل شود. بدون داشتن یک توافق مشخص در مورد مسوولیت رفع عیوب و ارائه خدمات پشتیبانی، ممکن است سازمان مجبور شود هزینه‌های هنگفتی را برای تعمیر یا جایگزینی سیستم متحمل شود. همچنین، ممکن است مدت زمان طولانی برای رفع مشکلات فنی صرف شود که این امر می‌تواند به طور قابل توجهی به بهره‌وری سازمان آسیب برساند.